南京共有52所大学，具体名单如下：
南京大学、东南大学、南京航空航天大学、南京理工大学、南京工业大学、南京邮电大学、河海大学、南京林业大学、南京信息工程大学、南京农业大学、南京医科大学、南京中医药大学、中国药科大学、南京师范大学、南京财经大学、江苏警官学院。
南京体育学院、南京艺术学院、南京工业职业技术大学、南京工程学院、南京审计大学、南京晓庄学院、南京特殊教育师范学院、南京警察学院、金陵科技学院、江苏第二师范学院、三江学院、东南大学成贤学院、南京大学金陵学院、南京理工大学紫金学院。
南京航空航天大学金城学院、南京传媒学院、南京工业大学、浦江学院、南京审计大学金审学院、江苏经贸职业技术学院、江苏联合职业技术学院、江苏海事职业技术学院、南京交通职业技术学院、南京科技职业学院、南京铁道职业技术学院、南京信息职业技术学院。
江苏城市职业学院、南京城市职业学院、南京机电职业技术学院、南京旅游职业学院、江苏卫生健康职业学院、应天职业技术学院、正德职业技术学院、钟山职业技术学院、金肯职业技术学院、南京视觉艺术职业学院。
南京排名前三的大学：
1、南京大学
南京大学，简称南大，是一所历史悠久、声誉卓著的高等学府。其前身是三江师范学堂。在一个多世纪的办学历程中，南京大学及其前身与时代同呼吸、与民族共命运，谋国家之强盛、求科教之进步，为国家的富强和民族的振兴做出了重要的贡献。南京大学在崭新的历史机遇中焕发出新的生机。
南京大学是首批入选国家“211工程”和“985工程”建设序列，首批入选国家“双一流”建设高校，首批入选国家级双创示范基地，始终处于中国大学的第一方阵，获得了公认的社会影响和学术声誉。
2、东南大学
东南大学，简称东大，位于南京市，是中央直管、教育部直属的副部级全国重点大学，中国著名的建筑老八校及原四大工学院之一。东南大学创办于1902年，以工科和理科见长。其前身是创建于1902年的三江师范学堂和创建于1906年的清华留美预备学校。1921年更名为东南大学。
3、南京航空航天大学
南京航空航天大学，简称南航，位于江苏省南京市，是中华人民共和国工业和信息化部直属的一所具有航空航天民航特色、以理工类为主的综合性全国重点大学，是国家“双一流”建设高校，国家“211工程”。南京航空航天大学始是新中国成立后第一所航空航天类高等院校。
以上数据出自东南大学官网。