副科和三级主任科员各有优劣。
职级并行，实职副科对应的四级主任科员，副科满两年可以直接转为三级主任科员。
工资方面，同一人三级主任科员比实职副科要多点，不过也多不了多少。
晋升方面，实职副科可以直接正科，也就是三进二，理论上在经过两年就可以转为一级主任科员，可每个单位都有职数限制，时间是可能比较久一些。
三级主任科员到一级主任科员最少需要4年的时间。也就是说完全从理论上来看，实职比走级别要快点，可现实情况就不可预见了。
职位方面，实职副科是职务，比方说在科级单位，实职副科就是领导班子成员了。可三级主任科员，就算是一级主任科员也是科员，要服从科长和副科长的管理。
三级主任科员和事业编副科实职，二者各有各的优势。至于排名，要区分具体情况、具体场合，三级主任科员未必一定排在事业编副科实职前面。我们瞎清以县直单位为例。
副科实职和三级主任科员如何选择？
一、从编制性质上排序，三敬神枝级主任科员排在事业编副科实职前面
三级主任科员使用的是公务员行政编制或者参公编制。而事业编副科实职，使用的是事业编。众所周知，编制类型的排序是：公务员编＞参公编制＞公益一类事业编＞公益二类事业编＞公益三类事业编。因此，三级主任科员的编制排名比事业编副科实职靠前。
二、从工资待遇上排序，三级主任科员排在事业编副科实职前面
以县直单位为例，三级主任科员，加上每月打卡工资、公积金、年终奖，全年总收入大概9.2万元；事业编副科实职，全年总收入大概8.5万元。可知，三级主任科员工资待遇高于事业编副科实职。
三、从政治待遇上排序，三级主任科员排在事业编副科实职后面
三级主任科员，在县直单位可能就是一般工作人员，可能不是单位党组成员，没有决策权、签字权，不能参与单位领导分工，可能享受不到副科实职的政治待遇和工作待遇。
而事业编副科实职，在县直事业单位属于单位领导，甚至可能是单位一把手，在单位拥有至高无上的一把手权力，拥有工作安排权、人事调配权、重大事项决策权。这方面，事业编副科实职要排在三级主任科员前面。
四、从社会地位上排序，三级主任科员排在事业编副科实职后面
三级主任科员，由于在单位是一般工作人员，没有任何权力，掌握的资源不多，人脉资源较少，社会地位不是很高。而事业编副科实职，属于单位领导，掌握一定的社会资源，与其打交道的人员的层次相对较高，人脉资源相对较多，社会地位当然也就高一些。
五、从提拔晋升上排序，三级主任科员排在事业编副科实职前面
三级主任科员，在县直单位，即可转为副科实职，或者一步到位提拔正科级实职；或者可以晋升二级主任科员，享受正科级工资待遇。
而事业编副科实职，由于受编制限制，发展前景不是很广阔，在县直单位已经触摸到天花板，想要转为公务员，由于程序比较复杂，操作起来也有难度。因此，事业编副科实职在县直单位，几乎没有晋升的希望，极有可能在副科级位置上原地踏亮敏步、终此一生。