长兴县中医院的科室设施齐全，致力于为患者提供全方位的医疗服务。其中，儿科是一个重点发展部门，设有21张床位，配备有11名儿科医生，包括2名高级职称和5名中级职称的专业人员。儿科特色在于中西医结合治疗，例如儿童哮喘、过敏性紫癜和新生儿缺氧缺血性脑病的筛查与治疗，减少了并发症的发生。此外，医院还与浙江省肿瘤医院和浙一医院合作，开展肿瘤内科的化疗、穿刺和姑息性治疗，减轻患者痛苦，提高生活质量。
骨伤科与关节外科在骨关节疾病治疗方面也颇具实力，可以进行高龄老人的髋关节置换手术，以及采用吸收螺钉内固定技术减少二次疼痛。关节镜手术和中西医结合治疗股骨头坏死等都体现了医院的特色。五官科引进了先进设备，开展白内障手术和眼科多种手术，主任医师吴静在眼科有丰富的经验。
口腔科提供牙体病、口腔颌面外科和修复科的专业服务，包括牙周病、口腔手术和修复牙齿。内科采用中西医结合治疗各类常见疾病，疗效显著。皮肤科专注于皮肤病治疗，尤其在自体表皮移植治疗白癜风方面有显著效果。消化内科引进先进内镜设备，开展内窥镜下多种消化系统疾病治疗。针灸科则通过各种治疗项目帮助患者缓解各种疼痛和疾病症状，如针灸减肥和冬病夏治疗法也受到广泛认可。
长兴县中医院长兴县中医院是国标二级甲等中医院，是政府举办的非营利性医院。有高级职称医务人员28人、中级职称医务人员105人。开设了消化内科、中医内科、肾内科、骨伤科等专家门诊14个；专科门诊25个。核定床位300张，开放床位200张，设病区6个，2006年新开设了康复科和儿科病区。