1644年，清军入关，在北京建立清朝政权。1661年4月，郑成功以南明王朝招讨大将军的名义，率2.5万将士及数百艘战舰，由金门进军台湾。郑成功在进军台湾时，向荷兰殖民者表示，台湾“一向属于中国”，台湾和澎湖这两个“岛屿的居民都是中国人，他们自古以来占有和耕种这一土地”，荷兰“自应把它归还原主。”经过激烈战斗和围困，1662年2月，郑成功迫使荷兰总督揆一签字投降。郑成功从荷兰殖民者手中收复了中国领土台湾，成为一位伟大的民族英雄，受到广大人民的敬仰。
1884—1885年中法战争期间，法军进攻台湾，遭刘铭传率军重创，到1885年6月《中法新约》签定，法军被迫撤出台湾。
中法战争以后，清政府为了加强海防，于1885年将台湾划为单一行省，台湾成为中国第20个行省。
1894年日本发动甲午战争，翌年清政府战败，于4月17日被迫签订丧权辱国的《马关条约》，把台湾割让给日本。
1945年8月，日本在第二次世界大战中战败，8月15日宣布无条件投降。中国人民经过8年英勇的抗日战争，终于收复了台湾。
1949年12月，国共战争，国民党败退，蒋介石撤至台湾，收集残部，负隅孤岛。
1950年6月25日的清晨，三八线上的枪声终于打破了寂静，美国迅速改变了对台政策。6月27日，杜鲁门下令美国第七舰队进入台湾海峡“阻止对台湾的任何进攻”。6月29日，美国第七舰队的6艘驱逐舰，2艘巡洋舰和1艘运输舰侵入台湾海峡。
大陆成立中华人民共和国，两岸敌对多年，遂两岸隔绝至今。
蒋氏父子去世后，李登辉和陈水扁上台，大力推行台独政策，两岸关系恶化，渐行渐远。
2008年，马英就上台后，开始与大陆接触，目前两岸关系稍有好转。但本质未变。
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