法律分析：自建房建设许可证丢了，可以进行补办。先应按以下程序到房管局办理权属证书遗失登记和补办，具体流程如下：1、房屋权利人应持身份证到市房管局，填写房产证遗失声明；2、到房产档案馆查档并出具房产权属证明；3、在报上刊登权属证书遗失声明；4、6个月后，房管部门发布房屋所有权证书作废公告；5、房屋权利人持刊登遗失声明和作废公告的原版报纸、身份证及复印件等资料到市房产交易管理处办理遗失登记发证手续。
法律依据：《建设工程施工许可管理办法》第二条 在中华人民共和国境内从事各类房屋建筑及其附属设施的建造、装修装饰和与其配套的线路、管道、设备的安装，以及城镇市政基础设施工程的施工，建设单位在开工前应当依照本办法的规定，向工程所在地的县级以上人民政府建设行政主管部门（以下简称发证机关）申请领取施工许可证。