华润三九医药股份有限公司在业界取得了显著的荣誉。在2009年6月的评选活动中，它荣登了《中国证券报》举办的“第11届中国上市公司百强金牛奖”以及《证券时报》评选的“2008年度中国上市公司价值榜”，被评为“金牛百强”和“价值百强”。这体现了社会各界对公司2008年度业绩的极高评价和认可。
其强大的市场表现进一步得到资本市场的肯定。从2006年到2008年，公司业绩显著增长，这促使它在2009年7月1日起被纳入沪深300指数和深证100成份指数，同时入选沪深300相对成长指数、沪深300相对价值指数和医药卫生指数，以及中证中盘200指数，展现了其在行业中的领先地位。
2009年7月，华润三九医药还获得了由中国医药企业管理协会《医药经理人》杂志社颁发的“首届中国最具竞争力医药上市公司20强”称号。在评选中，公司的销售增长、利润增长、净资产收益率和利润绝对值等关键指标在参选的100余家医药企业中独占鳌头，证实了其在中国医药行业的强大竞争力。
华润三九医药股份有限公司（简称“华润三九”）是大型国有控股医药上市公司，前身为深圳南方制药厂。1999年4月21日，发起设立股份制公司。2000年3月9日在深圳证券交易所挂牌上市，股票代码000999。公司于2007年11月底正式进入华润集团。2010年2月，公司名称由“三九医药股份有限公司”正式变更为"华润三九医药股份有限公司"。