青枯病和枯萎病均是茄果类的重要病害。这两种病害从表面上看有相似之处：均为土壤传染的病害，连作发病严重；发病后植株均表现为地上部萎蔫；开始发病萎蔫的叶片早晚可恢复；低洼地、雨过天晴天气发生严重；病株维管束均变褐色等。但这两种病害存在较大的区别，青枯病属于细菌性病害，而枯萎病则是真菌性病害。另外，从发病表现看，两种病害也存在较大的差异：
发病初期，枯萎病病株的茎基部皮层呈水浸状，逐渐变褐色，植株自下而上逐渐变黄、萎蔫；而青枯病则无这种水浸状，发病后植株上部先萎蔫，其次是下部，中间最后萎蔫。
枯萎病病株常常出现植株一侧萎蔫，而另一侧正常，或至少田间一部分植株出现这种现象，但青枯病基本无此症状。
青枯病病株茎部，尤其是植株下部茎秆上，其表皮粗糙，茎秆中下部丛生不定根或不定芽，但枯萎病无此症状。
青枯病病株的病茎维管束变成褐色，横切新鲜病茎并用手挤压、或病茎横切面经保湿，在切面上维管束溢出白色菌液（具臭味）；枯萎病病株的病茎虽然也出现维管束变褐色的现象，但病茎横切面保湿培养也不会出现白色菌液。有时，特别是潮湿天气，枯萎病病部会产生粉红色霉状物或产生白色、蓝绿色霉状物，但无臭味。也可以将病茎折断后插于盛有清水的瓶中，几分钟后如果原来的清水变得浑浊，说明该病害是青枯病。