在投掷原子弹前美军为确定目标曾颇费头绪，目标应符合下列条件：该地应为日本的工业重镇，原子弹爆炸后可以沉重打击日本工业基础，其次该地应拥有日本重要的军事目标，原子弹爆炸后会影响日本的本土作战计划，第三，该地应没有盟军战俘，所以确定目标后定下广岛、长崎、京都、小仓四座城。广岛是日本重要的军事基地，日本第二方面军司令部驻地，工业发达，地势平坦，易与原子弹的破坏，该地还没有受到盟军的大规模轰炸，保存完好。还没有盟军战俘，小仓也是日本重要的军事基地和工业基地，长崎造船业发达，京都是日本有名的文化故都，轰炸后会摧毁日本的精神支柱。后来美军出于人道主义考虑把京都从目标中划除，确定第一目标广岛，第二目标小仓，第三目标长崎，广岛爆炸后日本拒绝投降，所以号称”博克“之车的B-29起飞轰炸小仓，由于等待气象飞机，燃料消耗过大，飞到小仓小仓云层过厚，无法投弹，所以飞行员紧急改飞长崎，飞到长崎后同样是多云天气，机长下令雷达投弹，但云层突然裂开一条缝，下面是长崎的第二目标三菱重工，所以美军毫不迟疑投弹。引爆原子弹。至于东京，1945年3月开始的李梅火攻已烧毁东京大部分建筑，第一次李梅火攻出动335架B-29，投弹2339吨，使整个东京东区只有3根电线杆还站着。死6万，伤10万，失踪8万，所以对东京投掷原子弹价值不大，其次，原子弹在东京爆炸可能会伤害到天皇，天皇是美国重点”保护动物“用麦克阿瑟的话说”还有用处“，杜立特第一次轰炸东京就下令机组严禁轰炸东京皇宫，因为他在1940年不列颠之战中在伦敦，亲眼目睹白金汉宫被炸后英国的愤慨。现在同样，美军即将在日本本土登陆，美军担心杀掉天皇会激起日本的怒火，使美军伤亡加大。从以上原因不能轰炸东京 .
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