法律分析：
旷工一天扣三天工资是不合法的，只扣除当天的劳动报酬是合理的。一般对于劳动者的矿工行为，可以通过行政处罚等方式进行处罚，对员工进行处罚，或者以影响绩效的方式来减少绩效工资，也可以扣除员工的奖金。对于劳动者的旷工行为可以用以下方式进行处理：一是行政处分，直至解除劳动合同。对于有旷工行为的职工，用人单位根据旷工的天数可以规定不同处分层级，比如警告、严重警告，直至解除劳动合同;二是赔偿损失。如果因为劳动者旷工使用人单位遭受经济损失的，用人单位可以向其主张损失赔偿。比如值班人员不到岗导致单位被盗;三是扣减绩效考核分数。比如单位可以将绩效考核分数与绩效工资挂钩，并规定旷工一天，扣减绩效考核分数5分。劳动者旷工导致绩效考核分数降低，绩效工资自然降低。四是扣减奖金。在法律上，奖金支付属于企业自主权范畴，用人单位在制定奖金发放政策时，完全可以规定：旷工一天，免除当月全部奖金。
法律依据：
《中华人民共和国劳动合同法》 第三十九条 劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；
（二）严重违反用人单位的规章制度的；
（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；
（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；
（五）因本法第二十六条 第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；
（六）被依法追究刑事责任的。
衍生问题：
公司员工旷工几天可以开除？
员工无故旷工7天，用人单位就能开除。员工无故旷工可以按照用人单位的用工规定解决。例如：1、员工无故旷工1-3天，扣2天基本工资；2、员工无故旷工超过3天在7天之内，解除用工关系或终止劳动合同；3、员工无故旷工超过7天，直接开除、单方面解除劳动关系。凡属下列情况之一者，按旷工论：(一)不经请假或请假未获批准而擅自离开工作岗位的。(二)请假期限已满，不续假或续假未获批准而逾期不归的。(三)不服从组织调动和工作分配，不按时到工作岗位工作的。企业，事业单位处分职工，工会认为不适当的，有权提出意见。企业单方面解除职工劳动合同时，应当先通知工会，工会认为企业违反法律，法规和有关合同，要求重新研究处理时，企业应当研究工会的意见，并将处理结果书面通知工会。职工认为企业侵犯其劳动权益而申请劳动争议仲裁或者向人民法院提起诉讼的，工会应当给予支持和帮助。
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