代垫运费和购买材料的运杂费都要放进增值税里算。
代垫运费抵扣进项税额要具体分析：
1、如果销售方承担运费，并由购买方代垫运费，在购买行为发生后由销售方归还给购买方，所以这个代垫的运费与购买成本没有实际联系，不属于购买价款及价外费用，这种情况就不应抵扣进项税额；
2、如果购买方承担运费，并由销售方代垫运费，在购买行为发生后由购买方将运费及购货款一并支付的，这个运费实际上是属于购买成本的一部分，如果取得相应税务机关认可的运费发票，这种情况应予抵扣进项税。
如何在实际当中新增价值或附加值在生产？
商品新增价值或附加值在生产和流通过程中是很难准确计算的。因此，中国也采用国际上的普遍采用的税款抵扣的办法。即根据销售商品或劳务的销售额，按规定的税率计算出销售税额，然后扣除取得该商品或劳务时所支付的增值税款，也就是进项税额，其差额就是增值部分应交的税额，这种计算方法体现了按增值因素计税的原则。
增值税征收通常包括生产、流通或消费过程中的各个环节，是基于增值额或价差为计税依据的中性税种，理论上包括农业各个产业领域（种植业、林业和畜牧业）、采矿业、制造业、建筑业、交通和商业服务业等，或者按原材料采购、生产制造、批发、零售与消费各个环节。
交通运输业包括陆路运输、水路运输、航空运输、管道运输。
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【法律依据】：《中华人民共和国增值税暂行条例》
第八条纳税人购进货物、劳务、服务、无形资产、不动产支付或者负担的增值税额，为进项税额。
下列进项税额准予从销项税额中抵扣：
（一）从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额。
（二）从海关取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额。
（三）购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和11%的扣除率计算的进项税额，国务院另有规定的除外。进项税额计算公式：
进项税额=买价乘扣除率
（四）自境外单位或者个人购进劳务、服务、无形资产或者境内的不动产，从税务机关或者扣缴义务人取得的代扣代缴税款的完税凭证上注明的增值税额。
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