供应商合作费用问题的风险可能涉及费用不透明、费用超出预算、费用变动频繁等情况。为了应对这些风险，可以采取以下措施：
明确费用条款： 在与供应商签订合同或协议时，明确费用条款，包括费用的具体项目、计算方法、支付方式等。确保双方对费用的理解一致。
合理预算规划： 在合作前进行充分的预算规划，考虑到各种可能的费用情况，避免在合作过程中因费用超出预算而造成困扰。
合同管理： 建立完善的合同管理机制，定期审核合同内容，确保供应商按照合同规定提供服务，并避免未经授权的费用增加。
费用透明度： 要求供应商提供详细的费用清单和报告，确保费用透明可查。如果费用有变动，要求供应商提前通知，并明确变动的原因和范围。
费用审批流程： 设立费用审批流程，确保所有费用的支付经过内部审核和审批，避免无效或不必要的费用支出。
定期审查： 定期对合作费用进行审查和分析，了解费用变化趋势，及时调整预算和控制措施。
供应商绩效评估： 将供应商的费用表现纳入绩效评估体系，根据费用的合理性和透明度对供应商进行评价，鼓励供应商合理控制费用。
技术支持： 利用供应链技术，实现费用数据的跟踪和分析，帮助识别费用问题和优化的机会。
风险管理： 针对不同的费用风险情况，制定相应的风险应对计划，预防和减轻可能的财务风险。
总之，应对供应商合作费用问题的关键在于合同规范、透明度和风险管理。通过明确的合作协议、严格的费用控制机制和定期的费用审查，可以有效降低与供应商合作费用相关的风险。