十三薪并不等同于年终奖。在发放机制上，十三薪与年终奖有着本质区别。年终奖属于劳动报酬或劳动福利，其发放通常与员工的绩效表现挂钩，用人单位在双方明确约定的情况下必须支付，并且不能随意克扣，还需对考核情况承担举证责任。相比之下，十三薪通常是指在年底时，用人单位按照约定向员工多发放一个月的工资，其性质更偏向于奖励，用人单位在相关制度中可以直接规定其支付条件。
首先，十三薪并非年终奖。十三薪也称为年底双薪，通常是单位年底按照约定向员工多发放一个月的工资。与年终奖劳动报酬的性质不同，十三薪被认为更侧重于奖励的性质，不属于用人单位必须支付的劳动报酬。
其次，十三薪并不必然等于年终奖。用人单位对于十三薪的支付制度具有更大的自主权。因为年终奖属于劳动报酬或劳动福利，在双方明确约定的情况下，用人单位不得随意克扣，并负有就考核情况进行举证的责任；十三薪则不同，用人单位可以直接在相关制度中对支付条件进行规定。
再者，关于年终奖的法律性质，由于缺乏明确的法律规定，实务中应从保护劳动者合法权益和兼顾用人单位经营管理自主权的原则出发，综合考虑双方的约定、劳动规章制度规定、发放惯例、劳动关系存续状态、双方过错等因素，以确定年终奖是否应当支付、如何支付以及标准如何确定。
最后，“十三薪”与年终奖都是工资的组成部分，但它们并不相同。“十三薪”是用人单位根据劳动合同约定向劳动者额外发放的月工资，属于工资的范畴，而年终奖则是基于全年经济效益和劳动者工作业绩的综合考核情况发放的一次性奖金，属于奖金的范畴。也就是说，十三薪是公司对员工进行的工资额外发放，性质上属于月工资；而年终奖是奖金的概念，性质上与之不同。
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