番茄畸形果是指番茄在低温、光照不足、肥水管理不善、植物生长调节剂使用不当时而出现的各种变形果实。番茄的畸形果，从形态上看有四种类型，即变形果、尖嘴果、瘤状果和脐裂果。变形果的果实在结构上没有发生很大的变化，但形状不整齐，有的呈椭圆形[图5（1）]，有的为桃形[图5（2）]；尖嘴果的果实在结构上也没有多大的变化，只是在果实的脐部长出一个乳头状突起[图5（3）]；瘤状果的果实在近萼片一端有瘤状凸起，其形如鼻，这是由子房发育初期，在其子房基部形成独立的心皮发育而成[图 5（4）]；脐裂果是早期果实中最常见的一种畸形果，在果实脐部的果皮开裂，以及露出胎座组织及种子向外翻转或裸露，这种脐裂果往往由于花朵的花柱开裂所形成的[图 5（5）]。
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图5 番茄畸形果的类型
引起番茄果实畸形的因素主要是花芽分化时温度偏低，形成畸形花，而这些畸形花坐果后即发育成畸形果；同时植物生长调节剂使用不当也会引起畸形果。一般的番茄品种，当幼苗具有2～3片真叶时，即开始进行花芽分化，当幼苗具有7～9片真叶时，已经完成3个花序的分化，秧苗进入现蕾或初花期。上述过程是在育苗期间完成的，当秧苗在第1～3个花序分化时遇到低温，一般平均温度在8℃以下，则极有可能形成畸形花；在这样的低温下，如果再加上潮湿、光照不足、氮肥过多，则形成畸形花的可能性更大。上述这些情况常常形成多心皮畸形花，进而发育成变形、桃形、瘤形果。如果苗龄过长，低温或干旱持续时间长，幼苗处于抑制生长条件下，花器容易木栓化，后转入适宜条件，木栓化组织不能适应内部组织的迅速生长，则形成脐裂果。因此，冬春番茄畸形果的发生率远高于秋番茄。如果在自然生长情况下，上述这些畸形花一般是不会结果的，畸形果的发生率较低，但由于目前广泛使用植物生长调节剂，使得原本不易结果的畸形花能够坐果，从而形成了畸形果。此外，植物生长调节剂对番茄畸形果形成的作用还表现在，使用浓度过高或处理时间（特别是指处理时花朵所处的发育程度）不当，极易产生乳突状畸形果。当然，品种不同，畸形果的发生率也是不同的。
预防番茄畸形果的方法必须根据形成畸形果的原因实行对症下药。主要有：
（1）选择适宜的品种 根据报道和试验，选用不易发生畸形果的番茄品种是预防果实畸形的主要措施之一，一般中、小果形的品种畸形果发生较大果形品种少。
（2）适时播种并创造良好的育苗环境 既然低温是引起畸形花的主要原因，预防番茄畸形花的产生最为根本的办法是提高育苗的温度。在长江中下游地区，如果于11月前后播种，则进入花芽分化期时刚好是温度较低的12月至翌年1月，因此需要加强苗床温度的管理；如果适当延迟播种，如在12月下旬至1月上旬播种，则秧苗进行花芽分化时的温度相对较高，不易形成畸形花。在进行低温锻炼时，也应根据秧苗所处的发育阶段，适当控制低温锻炼的程度。此外，应该控制适当的苗龄，一般早、中熟品种的苗龄不宜超过90天，晚熟品种的苗龄不宜超过100天。
（3）加强肥水管理 包括营养土的配制、育苗期间的追肥和水分补充等均应严格把关，避免氮肥过多，床土过于潮湿，并注意加强通风透光，以培育壮苗。
（4）合理使用植物生长调节剂 主要包括选择适宜的花朵，避免对畸形花进行激素处理；掌握处理时花朵的发育程度，避免处理过小的花蕾；掌握激素的使用浓度和每个花朵的用量。