已知RNA的二级结构，用哪个软件可以测得它的自由能

Question

我自己设计了一个预测RNA二级结构的软件，但是每次都会预测出多个二级结构，我想计算出每个结构的自由能，不知道用哪个软件可以计算出来，怎么用啊？rnafold等软件只计算最小自由能结构的能量，改了程序也计算不了。

Answer 1

RNAstructure可以，把自由能差别那项调大一点就可以了。RNAstructure网上有免费下的。