一、性质不同
1、公允价值变动收益： 以公允价值计量且其变动计入当期损益的交易性金融资产的一个科目。
2、投资收益：指企业或个人对外投资所得的收入（所发生的损失为负数）。
二、会计处理不同
1、公允价值变动收益：公允价值变动收益是新会计准则下新增加的科目，在企业计提“坏账准备、存货跌价准备、持有至到期投资减值准备”时，在旧会计准则下，计提的坏账准备、存货跌价准备都借记“管理费用”，贷记“坏账准备、存货跌价准备”等
2、投资收益：本科目应当按照投资项目进行明细核算。
三、特点不同
1、公允价值变动收益：应借记“交易性金融资产－公允价值变动”，贷记“公允价值变动损益”，公允价值低于其账面价值的差额，则做相反的分录。
2、投资收益：对外投资所取得的利润、股利和债券利息等收入减去投资损失后的净收益。
参考资料来源：
1、收益方式不同：
投资收益是企业或个人对外投资所得的收入(所发生的损失为负数)，如企业对外投资取得股利收入、债券利息收入以及与其他单位联营所分得的利润等。公允价值变动收益是资产或负债因公允价值变动所形成的收益，所属内部收益。
2、收益性质不同：
公允价值变动损益针对的是那些以公允价值计量的资产，主要包括交易性金融资产（如股票、债券、期货、基金等）、投资性房地产、衍生金融资产、金融负债四大类。投资收益是当投资性资产出售后，实实在在的获利或者亏损才会反应在投资收益中。
3、会计处理方式不同：
公允价值变动收益在新会计准则下新增加的科目，企业计提“坏账准备、存货跌价准备、持有至到期投资减值准备”时，在新会计准则下，计提的坏账准备、存货跌价准备都借记“资产减值损失”，贷记“坏账准备、存货跌价准备”等。
可以把它当成“管理费用”来理解（但并不是管理费用），“资产减值损失”科目余额在月末要转入“本年利润”科目。
投资收益核算企业根据长期股权投资准则确认的投资收益或投资损失，应当按照投资项目进行明细核算，期末将本科目余额转入“本年利润”科目，本科目结转后应无余额。
参考资料来源：百度百科-投资收益
参考资料来源：百度百科-公允价值变动收益
本回答被网友采纳“公允价值变动收益” 这个科目，是“以公允价值计量且其变动计入当期损益的交易性金融资产”的一个科目。在资产负债表日，“交易性金融资产”的公允价值高于其账面价值的差额，应借记“交易性金融资产－公允价值变动”，贷记“公允价值变动损益”，公允价值低于其账面价值的差额，则做相反的分录。你也可以象理解“投资收益”这个科目一样去理解“公允价值变动损益”。
2、交易性金融资产的损益属于损益类科目。本回答被提问者采纳
顺便说一句；再简单点说。（这样做的原因是？当中那些个变动在最后都是不算的）
原来计入"，卖掉是1200，现在是250;的=50借方，所以在损益表里也不应再体现什么公允价值变动损益：投资收益
50
贷，金融资产已经没了有这么一个规定，你那个好像反了，而所有的损益都在投资收益里反映，这个金融资产你买来是成本1000。所以最后应该做一笔调整分录
借：原计入公允价值变动损益的部分在处置该交易性金融资产是要确认为投资收益