氧化物类矿物晶体结构中的化学键以离子键为主，其结构一般可用最紧密堆积原理来阐述，并服从鲍林法则。当阳离子的配位数为4和6时，可看成是O2－作紧密堆积，阳离子充填在其八面体和四面体空隙中而构成。并且，随着阳离子电价的增加，共价键的成分趋于增多，如刚玉Al2O3已具有较多的共价键成分，石英SiO2则共价键占优势。另一方面，阳离子类型的不同，键性亦发生改变，即随着从惰性气体型、过渡型离子向铜型离子转变时，共价键则趋于增强，同时阳离子配位数趋于减少，如赤铜矿Cu2O，如果按阴阳离子半径比值(rc/ra=0.46/1.38=0.333)计算Cu的配位数为4，但实际上Cu的配位数为2。这种阳离子配位数(即成键数)的减少是由于共价键的结果。
在氢氧化物类矿物的结构中，由(OH)－或(OH)－和O2－共同形成紧密堆积，在后一种情况下(OH)－和O2－通常呈互层分布。氢氧化物的晶体结构主要是层状或链状，与相应的氧化物比较，其对称程度降低。在氢氧化物中除离子键外，还往往存在氢键。由于氢键的存在，以及(OH)－的电价较O2－为低而导致阳离子与阴离子间键力的减弱，因此与相应的氧化物比较，其相对密度和硬度都趋于减小。