蛋白质主要的理化性质以及对应的分离纯化方法如下：
电荷 Charge：
等电聚焦 isoelectricfocussing
离子交换 Ion-Exchange
等电点沉淀 Isoelectric precipitation
疏水性 Hydrophobicity：
反相层析 Reverse phase chromatography
疏水层析Hydrophobic interaction chromatography
亲和性 Affinity：
染料配体层析 Dye ligand chromatography
共价层析 Covalent chromatography
生物特异层析 Biological specific chromatography
免疫吸附层析 Immunoadsorption chromatography
金属鳌合层析 Metal Affinity Chromatography
分子量 Molecular Weight：
透析 Dialysis
超滤 Ultrafiltration
凝胶过滤 Gel filtration
SDS-PAGE电泳 Electrophoresis
溶解度 Solubility：
盐析Salt out
有机溶剂沉淀 Organic solvent precipitation
结晶 Crystallization
萃取 Extraction