咖啡对心血管是一个危险因素。咖啡中含有超过1000种生化活性物质，其中一些（如咖啡因）对心脏有害,咖啡摄入量增加会伴随冠状动脉疾患风险的升高,咖啡短期内对冠心病有危害且咖啡在体内的代谢方式也可能会影响冠心病。咖啡因代谢缓慢个体中服用咖啡可以增加非致命心肌梗死风险。咖啡的泡制方法也对人体有影响。喝煮（无滤过）咖啡升高血清胆固醇水平。增高胆固醇物质是双萜，它可以在沸水中自咖啡提出。咖啡内含有抗氧化物质咖啡鞣酸，它可以抑制6-磷酸葡萄糖酶系统并降低肠道对葡萄糖的吸收。
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