研究蛋白质和DNA的相互作用用什么方法比较好

Question

如题所述

Answer 1

具体选用什么方法还要看你用什么实验模型。以我所想到的，以体外做细胞培养比较合适。EMSA（即PRP提到的 gel mobility shift）是比较合适的方法。

但EMSA只是测定蛋白与DNA的BIND 能力强弱。楼主的题目和提问的主体似乎有些不相符合。意思是说要研究的这个蛋白作用在c-myc 基因的启动子上吗？如果是这样，不用c-myc 基因就行，只把它的启动子找出来，连到报告基因上，转染细胞就行了。如果是这种情况，我们可以再讨论。

除了BIND能力强弱，还要看最终对c-myc 基因表达的影响，所以测基因表达的一系列，RT-PCR了，WB了，都是不可少的。