持港澳通行证和两地签注，可以直接从香港坐船去澳门
港澳通行证
俗称双程证，是由中华人民共和国公安部出入境管理局签发给中国内地居民因私往来香港或澳门地区旅游、探亲、从事商务、培训、就业、留学等非公务活动的旅行证件。
来港澳前，必须取得内地公安部门签发有关来港澳目的签注（如团队旅游、个人旅游、商务或其他签注等）。
持中国公民有效护照经香港前往其它国家或地区的过境旅客如能符合一般的入境规定，包括持有前往目的地的有效入境证件及供海外旅游并已经确认的续程车/船/机票，可在每次入境时获准在港逗留7天而无需事先领有进入认可。
内地居民因私往来香港或澳门特别行政区旅游、探亲、从事商务、培训、就业等非公务活动，向户口所在地的市、县公安出入境管理部门提出申请。凭公安出入境管理部门签发的往来港澳通行证及有效签注前往。
持港澳通行证如何进入香港?
有港澳通行证不行，还必须有效签注才能进入香港。2.团队旅游签注(L)要求必须跟团出内地境，这是内地规定的，香港不会限制你你个人入境。
可以在深圳关口找旅行社送关，也可以直飞香港，在飞机出境地找旅行社送关。
团队游办个人过关 程序如下：
可以自由去，自由行，无须跟旅游团走；
只需提前一天找旅行社帮你办理团队签过关名单；
所需资料：你通行证上有照片那页-包括：姓名、证件号码、签发地、通行证号码等；
过关流程：出发当天在关口联系上送关员，拿好过关单和港澳通行证排队进关，入境后可以自由活动，逗留七天时间（回程无须办理其它手续） 。
可以的，拿通行证在两地海关办理出境入境。在码头大概十五分钟一班船，需一个小时到达。还有直升飞机，好像十分钟吧就到了。
同时几个细节提供：
如果你买票进入候船区后，前一班船还没开，而且有空座，可以直接申请去做前一班船，这个真的挺人性化的。
一般到了直接买票就可以，高峰期可能需要提前买票（不过基本没遇到过）。
超大行李会在进门口有人拦着收费，但相对随机，建议如果有大箱子，进门时加快脚步，呵呵。